Spôsob, ako overiť elektronický podpis prijatého elektronického dokumentu, závisí od typu (formátu) daného dokumentu.
Dokument (napr. faktúru) vo formáte PDF je možné overiť priamo v programe Adobe Reader minimálne vo verzii 9.1., vo verzii 8.0 nie je elektronický podpis dostupný. Používateľ si môže elektronický podpis vizuálne skontrolovať priamo pri zobrazení dokumentu (Obrázok č. 1).
Niekedy však na korektné zobrazenie elektronického podpisu je potrebné mať v Adobe Acrobat Reader nainštalovaný bezpečnostný certifikát. Návod na pridanie certifikátu je zobrazený v Obrázku č. 2.
OBERON umožňuje automaticky overiť elektronický dokument vo formáte XML (pri importe údajov - XML komunikácia alebo transport údajov). Okrem overenia elektronického podpisu a dokumentu (kontrola, či nebol pozmeňovaný) je možné overiť, či daný elektronický dokument skutočne patrí tomu, od koho pochádza - teda danému obchodnému partnerovi. Vtedy je však potrebné priradiť danému obchodnému partnerovi jeho certifikát (verejný klúč) podľa tohto postupu:
Obrázok č. 2 znázorňuje elektronický podpis v XML súbore. Textová časť (element Signature) vložená na konci XML súboru nesie informáciu elektronického podpisu.
Ak používateľ, ktorý nemá zadaný certifikát na vytvorenie elektronického podpisu, vytvorí XML dokument (exportuje údaje vo formáte XML), elektronický podpis sa, samozrejme, nevytvorí a dokument nebude obsahovať element Signature.