V adresári sa nachádzajú dokumenty firmy, ktoré boli vytvorené systémom OBERON, napríklad Daňové priznanie, Kontrolný výkaz DPH, mesačné hlásenie pre Sociálnu poisťovňu, pre zdravotné poisťovne v elektronickej podobe atď. Dokumenty sú členené podľa roka, mesiaca, a podľa toho, či dokument patrí do miezd alebo do účtovníctva.

V adresári _Export_Import sa nachádzajú súbory vytvorené systémom OBERON určené na export, prípadne import údajov, napr. homebanking, transport údajov.

Súbory v tomto adresári sa automaticky nevymazávajú. V prípade vymazania niektorého zo súborov z tohto adresára nie je funkčnosť účtovných programov ohrozená.

V prípade vymazania celého adresára nie je funkčnosť účtovných programov ohrozená, adresár sa po spustení programu znovu automaticky vytvorí.

V tomto adresári sa nachádzajú stiahnuté aktualizácie OBERON-u. V adresári Update sa nachádzajú tieto podadresáre:

- UpdateDescriptions - stručné popisy k aktualizácii (čo je nové)

- UpdateFiles - uložené aktualizácie OBERON-u

V adresári Update pribudne súbor vtedy, keď sa stiahnutý súbor presunie z dočasného adresára Temp.
Ak dôjde k vymazaniu adresára Update, nie je ohrozená činnosť systému OBERON, program OBERON Center bude sťahovať aktualizácie nanovo.

Adresár DATA_FileRepository je určený pre súbory Knižnice dokumentov a obrázkov v prípade použitia SQL servera.

Adresár je určený na ukladanie transformačných šablón XSLT, prípadne ďalších údajov.

V tomto adresári sa nachádzajú údaje účtovných jednotiek (firiem). Každý adresár predstavuje údaje jednej firmy. Bližsie informácie o adresári firmy sú obsiahnuté v téme Popis adresára s údajmi.

Ak chcete zálohovať všetky dátové súbory účtovníctva, stačí ak zazálohujete obsah tohto adresára, prípadne len všetky súbory s príponou MDB.
Program bude pracovať aj s údajmi, ktoré sa nachádzajú aj mimo tohto adresára, dokonca aj na inom disku, ako je to v prípade sieťovej prevádzky. Kde sú umiestnené súbory, s ktorými program pracuje, je možné zistiť nahliadnutím do súboru C:\OBERON\SHARE\SYSTEM\OBERON_settings.xml.

V tomto adresári sa nachádzajú doplnky stiahnuté a nainštalované pomocou Správcu doplnkov.

V podadresári SYSTEM je umiestnený program OBERON - Agenda firmy.

V podadresári SYSTEM je umiestnený program OBERON Center.

V adresári SHARE sú umiestnené súbory spoločné pre niekoľko programov OBERON.

Je tu umiestený podadresár REPORTS, v ktorom sú súbory s príponou RPT, t. j. súbory tlačových výstupov. Tieto tlačové výstupy sú spoločné pre niekoľko programov OBERON-u. Súbory tlačových výstupov programu OBERON sa nachádzajú v adresári \SYSTEM\Reports a majú príponu mrt.

V adresári sa nachádza aj podadresár SERVIS, v ktorom je program VNC pre vzdialenú pomoc.

V adresári TEMP sa nachádzajú dočasné súbory účtovných programov OBERON. Dočasné súbory slúžia napr. na uloženie čiastkových výsledkov operácií, na uloženie tzv. LOG súborov (informačné súbory určené na zaznamenávanie priebehu funkcií) a pod.

V prípade vymazania niektorého zo súborov z tohto adresára nie je funkčnosť účtovných programov ohrozená.

V tomto adresári sa nachádzajú súbory pre Inštaláciu webové služby a jej ďalší chod. Ide o súbory webovej stránky.